Rekening houden met het weer in Pitalito is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 18 °C. De koudste maanden zijn augustus en september, met een gemiddelde temperatuur van 17 °C De maanden met de meeste regen in Pitalito zijn april, maart, mei en juni. Deze maanden valt er gemiddeld 305 mm regen.