Het weer is waarschijnlijk een belangrijke factor als je je reis plant naar Khlong Yai. Vergeet niet dat de goedkopere opties meestal beschikbaar zijn als het weer minder goed is. De warmste maanden zijn gewoonlijk april en maart, met een gemiddelde temperatuur van 27 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C De maanden met de meeste regen in Khlong Yai zijn september, juli, augustus en juni. Deze maanden valt er gemiddeld 500 mm regen.