Het weer is waarschijnlijk een belangrijke factor als je je reis plant naar Wajima. Vergeet niet dat de goedkopere opties meestal beschikbaar zijn als het weer minder goed is. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 23 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 6 °C De maanden met de meeste regen in Wajima zijn september, juli, december en augustus. Deze maanden valt er gemiddeld 231 mm regen.