Het weer is waarschijnlijk een belangrijke factor als je je reis plant naar Honjo. Vergeet niet dat de goedkopere opties meestal beschikbaar zijn als het weer minder goed is. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 23 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 3 °C De maanden met de meeste regen in Honjo zijn september, juli, oktober en juni. Deze maanden valt er gemiddeld 227 mm regen.