Rekening houden met het weer in Chora Folegandros kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 25 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van 15 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Chora Folegandros is 350 mm.