Het weer speelt waarschijnlijk een grote rol als je je reis plant naar Ambon. Vergeet niet dat de goedkopere opties meestal beschikbaar zijn als het weer minder goed is. De warmste maanden zijn gewoonlijk januari en december, met een gemiddelde temperatuur van 28 °C. De koudste maanden zijn augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 26 °C De maanden met de meeste regen in Ambon zijn mei, juni, juli en april. Deze maanden valt er gemiddeld 350 mm regen.