Volgens de Azerbeidzjaanse historici gaat de naam van de stad terug naar het etnoniem van de Sakas, die het grondgebied van het hedendaagse Azerbeidzjan in de 7e eeuw voor Christus bereikte en het gedurende verschillende eeuwen bewoonde. Het gaat terug naar een tijd, toen het was een marktcentrum op de zijderoute, die Dagestan, Rusland verbond met de noordelijke handelsroutes door de Kaukasus. Veel openbare plaatsen en particuliere huizen in Shaki zijn versierd met shebeke, een houten rooster van stukjes gekleurd glas, bij elkaar gehouden zonder lijm of een enkele nagel. De techniek is complex en alleen bekend bij een paar ambachtslieden die hun nauwgezette ambacht van generatie op generatie doorgeven. Het paleis van Shaki Khans, dat een zomerresidentie van Shaki Khans was, blijft nog steeds een van de meest zichtbare bezienswaardigheden van Shaki. Gebouwd in 1762 zonder een enkele nagel is een van de mooiste monumenten van zijn tijdvak. Historisch centrum van Sheki met het paleis van Khan werd in juli 2019 toegevoegd aan de Werelderfgoedlijst van UNESCO.