Rekening houden met het weer in Gisenyi is belangrijk voor het plannen van je reis, vooral als je aan het zwembad wilt liggen. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en februari, met een gemiddelde temperatuur van 20 °C. De koudste maanden zijn november en december, met een gemiddelde temperatuur van 19 °C De gemiddelde jaarlijkse neerslag in Gisenyi is 1214 mm.