Rekening houden met het weer in Naganohara kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk augustus en juli, met een gemiddelde temperatuur van 19 °C. De koudste maanden zijn januari en februari, met een gemiddelde temperatuur van -1 °C De maanden met de meeste regen in Naganohara zijn juli, augustus, juni en september. Deze maanden valt er gemiddeld 246 mm regen.