Rekening houden met het weer in Joanópolis kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk september en februari, met een gemiddelde temperatuur van 20 °C. De koudste maanden zijn juli en juni, met een gemiddelde temperatuur van 16 °C De maanden met de meeste regen in Joanópolis zijn januari, december, februari en november. Deze maanden valt er gemiddeld 282 mm regen.