Rekening houden met het weer in Nueva Loja kan helpen om meer tijd aan het zwembad door te kunnen brengen tijdens je reis. De warmste maanden zijn gewoonlijk september en oktober, met een gemiddelde temperatuur van 25 °C. De koudste maanden zijn juli en augustus, met een gemiddelde temperatuur van 23 °C De maanden met de meeste regen in Nueva Loja zijn april, mei, maart en juni. Deze maanden valt er gemiddeld 593 mm regen.